蜥蜴是爬行动物中的一大类群,其生存环境多样，从沙漠到雨林均有分布，为了适应不同的生态位，蜥蜴演化出了一套高效且独特的呼吸系统，这不仅是其生命活动的核心保障，也体现了脊椎动物呼吸系统由简单到复杂演化过程中的一个重要环节。
蜥蜴的呼吸系统主要由鼻腔、气管、支气管和肺组成，整体结构相较于两栖动物更为完善，但又不同于鸟类和哺乳动物那般高度特化，其核心特征在于肺的结构。
鼻腔与气管：空气首先经外鼻孔进入鼻腔，蜥蜴的鼻腔内通常有简单的鼻甲结构，能起到初步湿润、过滤空气及嗅觉作用，随后空气通过喉部进入气管，蜥蜴的气管由一系列完整的软骨环支撑，确保气道畅通。
肺的主体结构：蜥蜴的肺是一对位于体腔前部、胸腔两侧的囊状器官，与哺乳动物复杂的“支气管树-肺泡”结构不同，大多数蜥蜴的肺呈现简单的囊状或开始出现初步分隔，其内壁并非光滑，而是演化出了蜂窝状或海绵状的小隔室，这些隔室由内壁向内折叠形成，称为肺泡或肺小房，极大地增加了气体交换的表面积，隔室的复杂程度因种类而异：行动缓慢的鬣蜥类，肺内分隔相对简单；而活动敏捷的砂巨蜥等，其肺内分隔更复杂，表面积更大，以适应更高的代谢需求。
独特的呼吸机制：蜥蜴不具备哺乳动物那样的横膈膜，因此主要依靠肋间肌的收缩与舒张来改变胸腔容积，从而完成吸气和呼气，这是一个潮气式呼吸的过程，即空气单向进出，部分蜥蜴在剧烈运动时，甚至会通过咽部泵动来辅助通气。
进化上的优势与局限：这种结构相较于两栖动物的简单囊状肺是巨大的进步，使得蜥蜴能更高效地获取氧气，减少对皮肤呼吸的依赖，从而真正适应干燥的陆地生活，其气体交换效率仍低于拥有肺泡和连续气流式呼吸的鸟类，或拥有极大量肺泡的哺乳动物，这也解释了为何蜥蜴多为变温动物，其新陈代谢率相对较低。
值得注意的是,一些蜥蜴种类还演化出了特殊的呼吸适应结构，部分蛇蜥、石龙子等，具有一个发达、另一个退化的肺，更特别的是，某些水生蜥蜴（如海鬣蜥）能通过调整心律和血液分配，在潜水时大幅降低代谢，以适应长时间的屏气。
蜥蜴的呼吸系统结构是一种在陆地脊椎动物演化史上承前启后的精巧设计,它既保留了相对简单的囊状基础，又通过内部复杂化的隔室来提升效能，完美地平衡了其生理需求与演化成本，研究这一系统，不仅能让我们理解蜥蜴自身的生存奥秘，也为追溯脊椎动物呼吸系统的演化历程提供了生动的范例。